研究業績

論文リスト

2010 2011 2012

2009年以前

一般講演

2010 2011 2012

2009年以前

招待講演など

2010 2011 2012

2009年以前

外部資金導入


論文リスト



2012


L. Reissig, T. Iwata, T. Kikukawa, M. Demura, N. Kamo, H. Kandori and Y. Sudo*
"The influence of halide binding on the hydrogen bonding network in the active site of Salinibacter sensory rhodopsin I"
Biochemistry 51, in press (2012).


Y. Furutani*, K. Fujiwara, T. Kimura, T. Kikukawa, M. Demura and H. Kandori
"Dynamics of dangking bonds of water molecules in pharaonis halorhodopsin during chloride ion transportation"
J. Phys. Chem. Lett. 3, 2964-2969 (2012).


M. Sumii, A. Kawanabe, Y. Fan, Y. Furutani, L. S. Brown and H. Kandori*
"Comparative FTIR study of a new fungal rhodopsin"
J. Phys. Chem. B 116, 11881-11889 (2012).


K. Saito, H. Kandori and H. Ishikita*
"Factors that differentiate the H-bond strengths of water near the Schiff base in bacteriorhodopsin and Anabaena sensory rhodopsin"
J. Biol. Chem. 287, 34009-34018 (2012).


D. Yamada, Y. Zhang, T. Iwata, K. Hitomi, E. D. Getzoff and H. Kandori*
"FTIR study of the photoactivation process of Xenopus (6-4) photolyase"
Biochemistry 51, 5774-5783 (2012).


S. Sekharan*, K. Katayama, H. Kandori and K. Morokuma*
"Color vision: "OH-site" rule for seeing red and green"
J. Am. Chem. Soc. 134, 10706-10712 (2012).


K. Muroda, K. Nakashima, M. Shibata M. Demura and H. Kandori*
"Protein-bound water as the determinant of asymmetric functional conversion between light-driven proton and chloride pumps"
Biochemistry 51, 4677-4684 (2012)

K. Inoue, L. Reissig, M. Sakai, S. Kobayashi, M. Homma, M. Fujii, H. Kandori, and Y. Sudo*
"Absorption spectra and photochemical reactions in a unique photoactive protein, middle rhodopsin MR"
J. Phys. Chem. B 116, 5888-5899 (2012)

T. Kanti Maiti, K. Yamada, K. Inoue and H. Kandori*
"L105K mutant of proteorhodopsin"
Biochemistry 51, 3198-3204 (2012)


K. Yamada, A. Kawanabe, S. Yoshizawa, K. Inoue, K. Kogure and H. Kandori*
"Anomalous pH effect of blue proteorhodopsin"
J. Phys. Chem. Lett. 3, 800-804 (2012)


K. Katayama, Y. Furutani, H. Imai and H. Kandori*
“Protein-bound water molecules in primate red- and green-sensitive visual pigments”
Biochemistry
51, 1126-1133 (2012).


S. Yoshizawa*, A. Kawanabe, H. Ito, H. Kandori and K. Kogure*
"Diversity and functional analysis of proteorhodopsin in marine Flavobacteria"
Environ. Microbiol. 14, 1240-1248 (2012).

D. Yamada and H. Kandori*
"FTIR spectroscopy of flavin-binding photoreceptors"
Methods in Molecular Biology, in press (2012).


T. Iwata, S. Tokutomi, and H. Kandori*
Light-induced structural changes of the LOV2 domains in various phototropins revealed by FTIR spectroscopy
BIOPHYSYCS 7, 89-98 (2012)



2011


Y. Zhang, J. Yamamoto, D. Yamada, T. Iwata, K. Hitomi, T. Todo, E. D. Getzoff, S. Iwai and H. Kandori*
"Substrate Assignment of the (6-4) Photolyase Reaction by FTIR Spectroscopy"
J. Phys. Chem. Lett. 183, 2774-2777 (2011)


G. Dai, Y. Zhang, J. Tamogami, M. Demura, N. Kamo, H. Kandori and T. Iwasa*
"An Amino Acid Residue (S201) in the Retinal Binding Pocket Regulates the Photoreaction Pathway of Phoborhodopsin"
Biochemistry 50. 7177-7183 (2011)


V. A. Lorenz-Fonfria*, H. Kandori and E. Padros
"Probing specific molecular processes and intermediates by time-resolved Fourier-transform
infrared spectroscopy: Application to the bacteriorhodopsin photocycle"
J. Phys. Chem. B 115, 7972-7983 (2011).

H. Irieda, L. Reissig, A. Kawanabe, M. Homma, H. Kandori and Y. Sudo*
"Structural characteristics around β-ionone ring of the retinal chromophore in Salinibacter sensory rhodopsin I"
Biochemistry 50, 4912-4922 (2011).

T. Iwata, A. Watanabe, M. Iseki, M. Watanabe and H. Kandori*
"Strong donation of the hydrogen bond of tyrosine during photoactivation of the BLUF domain"
J. Phys. Chem. Lett. 2, 1015-1019 (2011).

Y. Zhang, T. Iwata, J. Yamamoto, K. Hitomi, S. Iwai, T. Todo, E. D. Getzoff and H. Kandori*
"FTIR study of light-dependent activation and DNA repair processes of (6-4) photolyase"
Biochemistry 50, 3591-3598 (2011).

J. Sasaki, H. Takahashi, Y. Furutani, H. Kandori and J. L. Spudich*
"Sensory rhodopsin-I as a flip-flop: Opposite conformational changes from the same photoisomerization"
Biophys. J. 100, 2178-2183 (2011).


K. Inoue*, Y. Sudo, M. Homma and H. Kandori
"Spectrally silent intermediates during the photochemical reactions of Salinibacter sensory rhodopsin I"
J. Phys. Chem. B 115, 4500-4508 (2011).

M. Shibata, T. Uchihashi, H. Yamashita, H. Kandori and T. Ando*
"Structural changes in bacteriorhodopsin in response to alternate illumination
observed by high-speed atomic force microscopy"
Angew. Chem. Int. Ed. 50, 4410-4413 (2011).

A. Nakatsuma, T. Yamashita, K. Sasaki, A. Kawanabe, K. Inoue, Y. Furutani, Y. Shichida and H. Kandori*
"Chimeric microbial rhodopsins containing the thrid cytoplasmic loop of bovine rhodopsin"
Biophys. J. 100, 1874-1882 (2011).

Y. Furutani, T. Murata and H. Kandori*
"Sodium or lithium ion-binding-induced structural changes in the K-ring of V-ATPase
from Enterococcus hirae revealed by ATR-FTIR spectroscopy"
J. Am. Chem. Soc. 133, 2860-2863 (2011).

Y. Sudo*, K. Ihara, S. Kobayashi, D. Suzuki, H. Irieda, T. Kikukawa, H. Kandori and M. Homma
"A microbial rhodopsin with a unique retinal composition shows both sensory rhodopsin II
and bacteriorhodopsin-like properties"
J. Biol. Chem. 286, 5967-5976 (2011).

神取秀樹
ロドプシンの分子科学
Mol. Sci. 5, A0043 (2011).

神取秀樹
「光といのち」を化学する
化学と工業 64, 885-887 (2011).


神取秀樹
分子研は生命科学にどう取り組むべきか?
分子研レターズ 64, 10-12 (2011).


A. Kawanabe, Y. Furutani, K.-H. Jung and H. Kandori*
"An inward proton transport using Anabaena sensory rhodopsin"
J. Microbiol. 49, 1-6 (2011).

H. Kandori
“Protein-Controlled Ultrafast Photoisomerization in Rhodopsin and Bacteriorhodopsin”
in "Supramolecular Effects on Photochemical and Photophysical Processes", V.
Ramamurthy, Y. Inoue, eds., John Wiley & Sons, Inc. Hoboken, pp. 571-595 (2011).

R. S. H. Liu, L.-Y. Yang, Y.-P. Zhao, A. Kawanabe and H. Kandori
“Supramolecular Effects on Mechanisms of Photoisomerization: Hula-Twist, Bicycle-Pedal and One-Bond-Flip”
in "Supramolecular Effects on Photochemical and Photophysical Processes", V.
Ramamurthy, Y. Inoue, eds., John Wiley & Sons, Inc. Hoboken, pp. 547-570 (2011).



2010


T. Iwata, Y. Zhang, K. Hitomi, E. D. Getzoff and  H. Kandori*
"Key dynamics of conserved asparagine in a cryptochrome/photolyase family protein by Fourier transform infrared spectroscopy"
Biochemistry 49, 8882-8891 (2010).

S. Kawaguchi, O. Kambara, M. Shibata, H. Kandori and K. Tominaga*
"Low-frequency dynamics of bacteriorhodopsin studied by terahertz time-domain spectroscopy"
Phys Chem Chem Phys. 12,10255-10262 (2010).

K. Katayama, Y. Furutani and H. Kandori*
"FTIR study of the photoreaction of bovine rhodopsin in the presence of hydroxylamine"
J Phys Chem B. 114, 9039-9046 (2010).


S. Neya*, M. Suzuki, T. Hoshino, H. Ode, K. Imai, T., Komatsu, A. Ikezaki, M. Nakamura, Y. Furutani
and H. Kandori
"Molecular insight into intrinsic heme distortion in ligand binding in hemoprotein"
Biochemistry 49, 5642-5650 (2010).


V. A. Lorenz-Fonfria, Y. Furutani. T. Ota, K. Ido and H. Kandori*
"Protein fluctuations as the possible origin of the thermal activation of rod photoreceptors in the dark"
J. Am. Chem. Soc. 132, 5693-5703 (2010).

K. Hashimoto, A. R. Choi, Y. Furutani, K.-H. Jung and H. Kandori*
"Low-temperature FTIR study of Gloeobacter rhodopsin: Presence of strongly hydrogen-bonded water and
long-range structural protein perturbation upon retinal photoisomerization"
Biochemistry 49, 3343-3350 (2010).

K. Yamada, A. Kawanabe and H. Kandori*
"Importance of alanine at position 178 in proteorhodopsin for absorption of prevalent ambient light in the marine environment"
Biochemistry 49, 2416-2423 (2010).

M. Shibata, H. Yamashita, T. Uchihashi, H. Kandori and T. Ando*
"High-speed atomic force microscopy shows dynamic molecular processes in photoactivated bacteriorhodopsin"
Nature Nanotechnol. 5, 208-212 (2010).

J. Yagasaki, D. Suzuki, K. Ihara, K. Inoue, T. Kikukawa, M. Sakai, M. Fujii, M. Homma, H. Kandori* and Y. Sudo*
"Spectroscopic studies of a sensory rhodopsin I homologue from the archaeon Haloarcula vallismortis"
Biochemistry 49, 1183-1190 (2010).

K. Katayama, Y. Furutani, H. Imai* and H. Kandori*
"An FTIR study of monkey green- and red-sensitive visual pigments"
Angew. Chem. Int. Ed. 49, 891-894 (2010).


H. Kandori
"Hydrogen Bonds of Protein-Bound Water Molecules in Rhodopsins" in "Hydrogen Bonding and Transfer in the Excited State",
K.-L. Han, G.-J. Zhao, eds., pp. 377-391, John Wiley & Sons Ltd, West Sussex (2010).


川鍋陽、古谷祐詞、神取秀樹
逆向きプロトン輸送タンパク質の創成
生物物理、50, 236-237 (2010).

H. Kandori, Y. Sudo and Y. Furutani
"Protein-Protein Interaction Changes in an Archaeal Light-Signal Transduction"
J. Biomed. Biotech. in press (2010).


内橋貴之、柴田幹大、山下隼人、神取秀樹、安藤敏夫
高速AFMイメージング技術で可視化する生体分子の機能動態
化学とマイクロ・ナノシステム研究会誌、9, 1-6 (2010).


 

一般講演



2012


片山耕大古谷祐詞、今井啓雄、神取秀樹
「全反射赤外分光法によるサル緑感受性視物質のクロライドイオン結合機構解析」
日本生物物理学会中部支部講演会、
2012319日、名古屋

山田大智 岩田達也 神取秀樹
「アニオンラジカル型による(6-4)光回復酵素のDNA修復」
2011年度生物物理学会中部支部講演会、2012319日、名古屋

神取秀樹
 
「フラビン蛋白質の赤外分光研究」
 
新学術領域研究「高次π空間」第7回公開シンポジウム2011313日、松山


T. Iwata
,
“Property of Flavin-binding Photoreceptors”
2nd Symposium on Life Science, March 7, 2012, Nagoya, Japan


T. Iwata, S. Ito, M. Iseki, M. Watanabe, and H. Kandori
“Hydrogen-bonding structures of the tyrosine and glutamine residues in the BLUF domain”

Gordon Research Conference “Photosensory Receptors & Signal Transduction”, January 24, 2012, Galveston, USA



2011


伊藤洋康、吉澤 晋、川鍋 陽、木暮一啓、神取秀樹
 
「プロテオロドプシンの生細胞での光駆動プロトンポンプ測定」
 
日本生体エネルギー研究会、20111221日、京都

山田大智 張宇 岩田達也 山元淳平、 人見研一、 岩井成憲、 藤堂剛、 E. D. Getzoff 神取秀樹
DNA光回復酵素の活性化と修復」
日本生体エネルギー研究会、20111221日、京都

神取秀樹
 
「イオン輸送生ロドプシンのイオン透過を考える」
 
日本生体エネルギー研究会、20111221日、京都

神取秀樹
 
「フラビン蛋白質の赤外分光研究」
 
特定領域研究「高次系分子科学」第6回合同班会議、2011129日、沖縄

井上圭一
「時間分解分光法によるミクロからマクロにおよぶタンパク質の反応ダイナミクスの理解」
特定領域研究「高次系分子科学」第6回合同班会議、
2011128日、沖縄

○H. Kandori
“FTIR study of flavin binding proteins in action”
3rd International Symposium on Emergence of Highly Elaborated p-Space and its Function
November 18, 2011, Tsukuba, Japan

○K. Sasaki, T. Yamashita, K. Inoue, Y. Shichida, and H. Kandori
Chimeric proton pumping rhodopsin containing the cytoplasmic loop of bovine rhodopsin”
3rd International Symposium on Emergence of Highly Elaborated
p-Space and its Function
November 18, 2011, Tsukuba, Japan

K. Muroda, K. Nakashima, M. Shibata, M. Demura and H. Kandori
“Tenfold mutant of pharaonis halorhodopsin”
3rd International Symposium on Emergence of Highly Elaborated
p-Space and its Function
November 18, 2011, Tsukuba, Japan


片山耕大古谷祐詞、今井啓雄、神取秀樹
 
「霊長類色覚視物質の内部結合水の構造解析」
 
17回錯体化学若手の会中部・東海地区勉強会、20111112日、名古屋

山田大智張宇岩田達也、人見研一、藤堂 剛、E. D. Getzoff神取秀樹
FTIRを用いた(6-4)光回復酵素の活性化過程における分光解析」

 17回錯体化学若手の会中部・東海地区勉強会、20111112日、名古屋

Y. Zhang, J. Yamamoto, D. Yamada, T. Iwata, K. Hitomi, S. Iwai, T. Todo, E. D. Getzoff
and H. Kandori
FTIR study of light-dependent activation and DNA repair processes of (6-4) photolyase
17th International Biophysics Congress and 12th National Biophysics Congress
October 31, 2011, Beijing, China

岩田達也
BLUFメインの光反応におけるチロシンとグルタミン残基の構造
新学術領域研究「植物の環境感覚:刺激受容から細胞応答まで」第2回若手の会、
20111026日、滋賀

岩田達也
「新規蛍光タンパク質の開発 -細胞内酸化還元状態の可視化-
名工大・名市大合同テクノフェア201120111020日、名古屋

D. Yamada, Y. Zhang, T. Iwata, K. Hitomi, T. Todo, E. D. Getzoff and H. Kandori
“Spectroscopic study of the photoactivation process of Xenopus (6-4) photolyase”
Joint of Morino Lecture and International Workshop "Spectroscopy on Photoinduced Functions of Electrons and Spins in Biology and Material Science", October 13, 2011, Tokyo, Japan

井上圭一L. Reissig、須藤雄気、本間道夫、神取秀樹
全反射赤外分光法によるセンサリーロドプシンIのイオン結合部位の構造研究
5回分子科学討論会、2011920日、札幌

張宇山田大智岩田達也山元淳平、人見研一、岩井成憲、藤堂 剛、E. D. Getzoff
神取秀樹
15Nラベルした(6-4)光産物修復の赤外分光観測」
5回分子科学討論会、2011920日、札幌

永田久美子井上圭一Kwang-Hwan Jung神取秀樹
「グロイオバクターロドプシン(GR)の光反応時間分解分光研究」
5回分子科学討論会、2011920日、札幌

T. Iwata, M. Iseki, M. Watanabe and H. Kandori
“Hydrogen-bonding structures of glutamine and tyrosine residues
during the photoreaction of the BLUF domains”
The 49th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 18, 2011, Himeji, Japan

I M. M. Wijaya, Y. Zhang, T. Iwata, J. Yamamoto, S. Iwai and H. Kandori
FTIR study of light-dependent activation and DNA repair processes of E. coli CPD photolyase
The 49th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 18, 2011, Himeji, Japan

D. Yamada, Y. Zhang, T. Iwata, J. Yamamoto, K. Hitomi, S. Iwai, T. Todo, E. D. Getzoff and H. Kandori
“Spectroscopic study of light-dependent activation and DNA repair processes of Xenopus (6-4) photolyase”
The 49th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 18, 2011, Himeji, Japan

T. Fukuda, Y. Yukutake, J. Kato, M. Yasui and H. Kandori
" ATR-FTIR study of the Zn-binding to Aquaporin-4 "
The 49th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 18, 2011, Himeji, Japan


R. Abe-Yoshizumi, K. Inoue, T. Iwata and H. Kandori
Functional conversion of green-proteorhodopsin by site-directed mutagenesis
The 49th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 17, 2011, Himeji, Japan

H. Ito, S. Yoshizawa, A. Kawanabe, K. Kogure and H. Kandori
In situ measurement of light-driven proton pump by proteorhodopsin of marine Flavobacteria
The 49th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 17, 2011, Himeji, Japan

K. Sasaki, T. Yamashita, K. Inoue, Y. Shichida, and H. Kandori
Chimeric proton pumping rhodopsin containing the cytoplasmic loop of bovine rhodopsin”
The 49th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 17, 2011, Himeji, Japan

K. Muroda, K. Nakashima, M. Shibata, M. Demura and H. Kandori
“Tenfold mutant of pharaonis halorhodopsin”
The 49th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 17, 2011, Himeji, Japan

Y. Kato, A. Kawanabe, K.-H. Jung and H. Kandori
“A mutational study of Anabaena sensory rhodopsin”

The 49th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 17, 2011, Himeji, Japan


C. Muramatsu, A. Kawanabe, T. Kimura, H. Kandori and Y. Furutani
Preparation and characterization of the fusion protein : KcsA and microbial rhodopsin
The 49th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 17, 2011, Himeji, Japan

K. Katayama, Y. Furutani, H. Imai and H. Kandori
 “Protein-bound water molecules in primate red- and green-sensitive visual pigments

 The 49th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 16, 2011, Himeji, Japan

D. Kawata, K. Katayama and H. Kandori
FTIR Study of the Interaction between Activated Rhodopsin and
the C-Terminal Peptide of Transducin
a-Subunit
The 49th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 16, 2011, Himeji, Japan

○張宇
(6-4)光回復酵素によるDNA修復の赤外分光観測」
51回生物物理若手の会夏の学校、2011827日、京都

片山耕大古谷祐詞今井啓雄神取秀樹
 
「霊長類色覚視物質の内部結合水の構造解析」
 
51回生物物理若手の会夏の学校、2011825日、京都

佐々木賢吾、山下高廣、井上圭一、七田芳則、神取秀樹
 「ロドプシンとプロトンポンプ型ロドプシンのキメラを用いた
Gタンパク質活性化機構の解明」

 
51回生物物理若手の会夏の学校、2011825日、京都

室田浩助中島啓介柴田幹大、出村 誠、神取秀樹
「ハロロドプシン十重変異体の研究」
51回生物物理若手の会夏の学校、2011825日、京都

川田大輝片山耕大神取秀樹
 
赤外分光法による活性化ロドプシンとトランスデューシンaサブユニットの
C末端ペプチドとの相互作用解析
 
51回生物物理若手の会夏の学校、2011825日、京都

山田大智張宇岩田達也、人見研一、藤堂 剛、E. D. Getzoff神取秀樹
「アフリカツメガエルの(6-4)光回復酵素における活性化過程の分光解析」
 51回生物物理若手の会夏の学校、2011825日、京都

T. Iwata, A. Watanabe, M.Iseki, M. Watanabe and H. Kandori
“Structure of tyrosine residue in the unphotolyzed and intermediate states of the BLUF domains”
5th Asia and Oceania Conference for Photobiology, July 31, 2011, Nara, Japan

D. Yamada, Y. Zhang, T. Iwata, K. Hitomi, T. Todo, E. D. Getzoff and H. Kandori
“Spectroscopic study of the photoactivation process of Xenopus (6-4) photolyase”
5th Asia and Oceania Conference for Photobiology, July 31, 2011, Nara, Japan

神取秀樹
「分光学的手法による生体π空間の制御機構解明と新機能の開拓」
新学術領域研究「高次π空間」第6回公開シンポジウム、2011714日、岡崎

井上圭一神取秀樹
新規時間分解分光計測による生体π空間のダイナミクス研究
過渡回折格子法による光受容タンパク質の時間分解エンタルピー測定
新学術領域研究「高次π空間」第6回公開シンポジウム、2011714日、岡崎

佐々木賢吾、山下高廣、中妻亜弥川鍋陽井上圭一、古谷祐詞、七田芳則、神取秀樹
「ロドプシンと微生物型ロドプシンのキメラタンパク質を用いた
Gタンパク質活性化機構の解明」

新学術領域研究「高次π空間」第6回公開シンポジウム、2011714日、岡崎

伊藤洋康川鍋 陽Ying FanLeonid S. Brown神取秀樹
新規カビ由来ロドプシンの赤外分光解析
新学術領域研究「高次π空間」第6回公開シンポジウム、2011714日、岡崎

○K. Inoue
Study on reaction dynamics of proteins that reaches from micro to macro by time-resolved spectroscopy
KAKENHI International Symposium on "Molecular Science for Supra Functional Systems",
July 13, 2011, Sapporo, Japan

岩田達也
フラビン結合光センサードメインを鋳型とした酸化還元状態感受性蛍光タンパク質の開発
新学術領域研究「植物の環境感覚:刺激受容から細胞応答まで」2011年度第1回班会議、2010627日、岡崎

片山耕大古谷祐詞、今井啓雄、神取秀樹
 
「霊長類色覚視物質の内部結合水の構造解析」
 
38回生体分子科学討論会、2011624日、筑波

山田大智張宇岩田達也、人見研一、藤堂 剛、E. D. Getzoff神取秀樹
(6-4)光回復酵素における活性化過程の分光解析
38回生体分子科学討論会、2011624日、筑波

井上圭一L. Reissig、須藤雄気、本間道夫、神取秀樹
全反射赤外分光によるSalinibacterセンサリーロドプシンI
塩化物イオン結合サイトの構造研究

日本化学会第91春季年会2011328日、神奈川

井上圭一神取秀樹
分光学的手法による生体π空間の制御機構解明と新機能の開拓
-
過渡回折格子法を用いたダイナミクス研究
新学術領域研究「高次π空間」第5回公開シンポジウム2011322日、吹田

佐々木賢吾、山下高廣、中妻亜弥川鍋陽井上圭一、古谷祐詞、七田芳則、神取秀樹
「ロドプシンと微生物型ロドプシンのキメラタンパク質を用いた
Gタンパク質活性化機構の解明」

新学術領域研究「高次π空間」第5回公開シンポジウム2011322日、吹田

片山耕大, 古谷祐詞, 今井啓雄, 神取秀樹
「霊長類色覚視物質の内部結合水の構造解析」
日本生物物理学会中部支部講演会、2011年3月31日、名古屋


T. Kanti Maiti, K. Yamada, K. Inoue and H. Kandori
"Effect of a positively charged lysine group in the 105 position of proteorhodopsin"
日本生物物理学会中部支部講演会、2011年3月31日、名古屋


K. Sasaki, T. Yamashita, A. Nakatsuma, A. Kawanabe, K. Inoue, Y. Furutani, Y. Shichida and H. Kandori
"Chimeric microbial rhodopsins containing the thrid cytoplasmic loop of bovine rhodopsin"
Keystone Symposia on "Transmembrane Signaling by GPCRs and Channels", January 25, 2011, Taos, USA

T. Kanti Maiti, K. Yamada, K. Inoue and H. Kandori
"L105K mutant of proteorhodopsin"
7th Asian Biophysics Association Symposium, February 1, 2011, New Delhi, India

○川田大輝
「赤外分光計測によるウシロドプシンとトランスデューシンの相互作用メカニズム解析」
2010
年度生物物理若手の会・生化学若い研究者の会合同セミナー「プレゼン道場」、
2011129日、名古屋




2010



K. Katayama, Y. Furutani, H. Imai and H. Kandori
“FTIR spectroscopy of monkey green- and red-sensitive pigments”
PACIFICHEM 2010, Symposium "Dynamics and Mechanisms of Photochemical Reactions of Biological Proteins", December 19, 2010, Honolulu, USA

Y. Zhang, T. Iwata, J. Yamamoto, K. Hitomi, S. Iwai, T. Todo, E. D. Getzoff and ○H. Kandori
“FTIR spectroscopy directly monitors photoactivation and photorepair processes of the (6-4) photolyase”
PACIFICHEM 2010, Symposium "Dynamics and Mechanisms of Photochemical Reactions of Biological Proteins", December 18, 2010, Honolulu, USA

K. Inoue, Y. Sudo, M. Homma and H. Kandori
“Study on the photo-reaction cycle of Salinibacter ruber sensory rhodopsin I”
PACIFICHEM 2010, Symposium "Dynamics and Mechanisms of Photochemical Reactions of Biological Proteins", December 18, 2010, Honolulu, USA

井上圭一
「時間分解分光法によるミクロからマクロにおよぶタンパク質の反応ダイナミクスの理解」
特定領域研究「高次系分子科学」第4回公開シンポジウム、2010年11月26日、仙台

岩田達也
「新しい機能を持ったタンパク質の開発-フラビンタンパク質から光回復酵素への機能転換-」
名工大・名市大合同テクノフェア2010、2010年11月17日、名古屋

I M. M. Wijaya, Y. Zhang, T. Iwata, J. Yamamoto, S. Iwai and H. Kandori
“New photorepair mechanism in the cryptochrome/photolyase family”
International Symposium on Highly Elaborated pi-Space and Its Function, November 13, 2010, Kyoto, Japan

K. Katayama, Y. Furutani, H. Imai and ○H. Kandori
"How can color visual proteins structurally control p-electrons of retinal? An FTIR study of monkey green- and red-sensitive visual pigments"
International Symposium on Highly Elaborated pi-Space and Its Function, November 11, 2010, Kyoto, Japan

井上圭一
「見えないものを見る分光学」
名古屋工業大学第1回化学公開セミナー、2010年11月10日、名古屋


Y. Zhang, T. Iwata, J. Yamamoto, K. Hitomi, S. Iwai, T. Todo, E. D. Getzoff and H. Kandori
"Direct Observation of Photoactivation and Photorepair Processes of (6-4) Photolyase by FTIR Spectroscopy"
The 9th International Conference on Photonics and Imaging in Biology and Medicine,
November 5, 2010, Wuhan, China

T. Iwata
“Structural analyses of flavin-binding photoreceptors by UV-Vis and FTIR spectroscopies”
Symposium on Life Science, October 15, 2010, Nagoya, Japan

I M. M. Wijaya, Y. Zhang, T. Iwata, J. Yamamoto, S. Iwai and H. Kandori
“FTIR study of photorepair of single strand DNA lesion by cryptochrome DASH”
2nd International Conference on Biotechnology and Biosciences, September 24, 2010, Bali, Indonesia

T. Iwata, A. Watanabe, M. Iseki, M. Watanabe and H. Kandori
“FTIR detection of structural changes of tyrosine residue that are crucial for the photoreaction of the BLUF domain”
The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 22-23, 2010, Sendai, Japan

Y. Asai, Y. Furutani, H. Shimizu, S. Oiki and H. Kandori
" Specific interaction between cations and KcsA channel studied by ATR-FTIR spectroscopy "
The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 22, 2010, Sendai, Japan

I M. M. Wijaya, Y. Zhang, T. Iwata, J. Yamamoto, S. Iwai and H. Kandori
“FTIR Study of Photorepair of Single Strand DNA Lesion by Cryptochrome DASH”
The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 22-23, 2010, Sendai, Japan

K. Katayama, Y. Furutani, H. Imai and H. Kandori
“ATR-FTIR spectroscopy of monkey green- and red-sensitive pigments”
The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 21, 2010, Sendai, Japan

K. Yamada, A. Kawanabe, S. Yoshizawa, K. Kogure and H. Kandori
“Conversion of blue proteorhodopsin into the green-type using abnormal pH effect”
The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 21, 2010, Sendai, Japan

K. Sasaki, T. Yamashita, A. Nakatsuma, K. Inoue, Y. Shichida and H. Kandori
“Chimeric proton-pumping rhodopsins containing the third cytoplasmic loop of bovine rhodopsin”
The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 21, 2010, Sendai, Japan

T. Fukuda, K. Muroda and H. Kandori
"Detection of a protein-bound water vibration in aqueous solution"
The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 20-21, 2010, Sendai, Japan

K. Muroda, M. Demura and H. Kandori
“Properties of S130D and S130E mutants of pharaonis halorhodopsin”
The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 21, 2010, Sendai, Japan

K. Inoue, M. Terazima, and H. Kandori
“Study on the photo reaction dynamics of bacteriorhodopsin by transient grating method”
The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 20, 2010, Sendai, Japan

Y. Zhang, T. Iwata, J. Yamamoto, K. Hitomi, S. Iwai, T. Todo, E. D. Getzoff and H. Kandori
"Low-temperature FTIR study of photoactivation and photorepair processes of (6-4) photolyase"
The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 20, 2010, Sendai, Japan

H. Ito, A. Kawanabe, Y. Fan, L. S. Brown and H. Kandori
“FTIR study of a new fungal rhodopsin”
The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 20, 2010, Sendai, Japan

片山耕大古谷祐詞神取秀樹
「ヒドロキシルアミン存在下でのウシロドプシンの赤外分光解析」
第4回分子科学討論会、2010年9月16日、大阪

井上圭一佐々木賢吾中妻亜弥、山下高廣、七田芳則、神取秀樹
「ロドプシン/古細菌型ロドプシンキメラタンパク質を用いたGタンパク質活性化機構の解明」
第4回分子科学討論会、2010年9月15日、大阪

張宇、高務真美、秋本誠志、岩田達也、人見研一、E. D. Getzoff、富永圭介、J. M. Christie、神取秀樹
「FMN結合型蛍光タンパク質iLOVの分光解析」
第4回分子科学討論会、2010年9月15日、大阪

浅井佑介古谷祐詞、清水啓史、老木成稔、神取秀樹
「KcsAの全反射赤外分光」
第50回生物物理若手の会夏の学校、2010年9月4日、一宮

片山耕大古谷祐詞、今井啓雄、神取秀樹
「サル緑・赤感受性視物質の全反射赤外分光解析」
第50回生物物理若手の会夏の学校、2010年9月4日、一宮

山田啓介川鍋陽、吉澤晋、木暮一啓、神取秀樹
「異常なpH効果による波長シフトの解析」
第50回生物物理若手の会夏の学校、2010年9月4日、一宮

伊藤洋康川鍋 陽、Y. Fan, L. S. Brown、神取秀樹
「新規カビ由来ロドプシンの赤外分光解析」
第50回生物物理若手の会夏の学校、2010年9月4日、一宮

佐々木賢吾中妻亜弥、山下高廣、井上圭一、七田芳則、神取秀樹
「プロトンポンプロドプシンのキメラを用いたロドプシンのGタンパク質活性機能相関の解明」
第50回生物物理若手の会夏の学校、2010年9月4日、一宮

福田哲也室田浩助神取秀樹
「タンパク質に結合した水分子の振動を水溶液中で測定する」
第50回生物物理若手の会夏の学校、2010年9月4日、一宮

室田浩助、出村 誠、神取秀樹
「ハロロドプシン変異体S130D, S130Eの研究」
第50回生物物理若手の会夏の学校、2010年9月4日、一宮


I M. M. Wijaya
“FTIR Study of Photorepair of Single Strand DNA Lesion by Cryptochrome DASH”
第50回生物物理若手の会夏の学校、2010年9月4日、一宮

永田久美子井上圭一神取秀樹
「過渡回折格子法を用いたグロイオバクターロドプシン(GR)の光反応の研究」
第50回生物物理若手の会夏の学校、2010年9月4日、一宮

山田大智張宇岩田達也、山元淳平、人見研一、岩井成憲、藤堂 剛、E. D. Getzoff、神取秀樹
「DNA修復機能が生まれる要因解明のためのアフリカツメガエル(6-4)光回復酵素の発現」
第50回生物物理若手の会夏の学校、2010年9月4日、一宮

浅井佑介古谷祐詞、清水啓史、老木成稔、神取秀樹
「KcsAの全反射赤外分光」
特定領域研究「高次系分子科学」第9回ミニ公開シンポジウム、広島、2010年 8月 30-30日

張 宇、○岩田達也、山元淳平、人見研一、岩井成憲、藤堂 剛、E. D. Getzoff、神取秀樹
「(6-4)光回復酵素の光活性化過程とDNA 修復過程解析の赤外分光法による観測」
第16回日本光生物学協会年会、2010年8月10日、大阪

K. Inoue, Y. Sudo, M. Homma and H. Kandori
“Spectrally silent process and conformational change on activated state of Salinibacter sensory rhodopsin I”
The 14th International Conference on Retinal Proteins, August 6, 2010, Santa Cruz, USA

K. Inoue
“Transient grating studies on photo-reaction dynamics of archeal rhodopsins”
The Seminar in Prof. Mathies Laboratory in University of California Berkeley, August 6, 2010, Berkeley, USA

K. Katayama, Y. Furutani, H. Imai and H. Kandori
“An FTIR study of monkey green- and red-sensitive visual pigments”
The 14th International Conference on Retinal Proteins, August 3, 2010, Santa Cruz, USA

K. Yamada, A. Kawanabe, S. Yoshizawa, K. Kogure and H. Kandori
“Conversion of blue proteorhodopsin into the green-type using abnormal pH effect”
The 14th International Conference on Retinal Proteins, August 3, 2010, Santa Cruz, USA

山田啓介川鍋 陽、○神取秀樹
「分光学的手法による生体π空間の制御機構解明と新機能の開拓:Proteorhodopsin の色を変える E-F ループの変異体」
新学術領域研究「高次π空間」第4回公開シンポジウム、2010年7月15日、筑波

岩田達也渡邉彰英、伊関峰生、渡辺正勝、神取秀樹
「FTIR分光法による青色光センサードメインBLUFの光反応に必須のチロシン残基の水素結合環境の検出」
第37回生体分子科学討論会、2010年6月19日、山口

片山耕大古谷祐詞、今井啓雄、神取秀樹
「霊長類 赤・緑感受性視物質の赤外分光解析」
第37回生体分子科学討論会、2010年6月18日、山口

井上圭一
「時間分解分光法によるミクロからマクロにおよぶタンパク質の反応ダイナミクスの理解」
特定領域研究「高次系分子科学」第5回班会議、2010年5月26日、淡路

中妻亜弥、山下高廣、佐々木賢吾川鍋 陽井上圭一古谷祐詞、七田芳則、○神取秀樹
「視物質と古細菌型ロドプシンのキメラを用いた構造機能相関の研究」
2010年度 京阪奈セミナー、2010年5月17日、京都

神取秀樹
「分光学的手法による生体π空間の制御機構解明と新機能の開拓」
新学術領域研究「高次π空間」第3回公開シンポジウム、2010年3月15日、岡崎


張 宇, 岩田達也, 山元淳平, 人見研一, 岩井成憲, 藤堂 剛, Elizabeth D. Getzoff, 神取秀樹
「(6-4) 光回復酵素によるDNA修復の赤外分光観測」
日本生物物理学会中部支部講演会、2010年3月、岡崎

片山耕大, 古谷祐詞, 今井啓雄, 神取秀樹
「霊長類色覚視物質の赤外分光解析」
日本生物物理学会中部支部講演会、2010年3月、岡崎

山田啓介川鍋陽吉次麻衣子神取秀樹
「Proteorhodopsinの色を変えるE-Fループの変異体」
日本生物物理学会中部支部講演会、2010年3月、岡崎

川鍋陽古谷祐詞、Kwang-Hwan Jung、神取秀樹
「センサーロドプシンを用いたプロトンポンプ研究 」
分子科学研究所研究会、2010年3月、岡崎

片山耕大, 古谷祐詞, 今井啓雄, 神取秀樹
「霊長類色覚視物質の赤外分光解析」
分子科学研究所研究会、2010年3月、岡崎

張 宇, 岩田達也, 山元淳平, 人見研一, 岩井成憲, 藤堂 剛, Elizabeth D. Getzoff, 神取秀樹
「(6-4) 光回復酵素によるDNA修復の赤外分光観測」
高次π空間の創発と機能開発 第三回公開シンポジウム講演、2010年3月、岡崎

浅井佑介, 古谷祐詞, 清水啓文, 老木成稔, 神取秀樹
「KcsAチャネルの全反射赤外分光解析」
高次π空間の創発と機能開発 第三回公開シンポジウム講演、2010年3月、岡崎

片山耕大, 古谷祐詞, 今井啓雄, 神取秀樹
「霊長類色覚視物質の赤外分光解析」
高次π空間の創発と機能開発 第三回公開シンポジウム講演、2010年3月、岡崎

岩田達也
「フラビンを発色団とする光センサータンパク質の反応制御機構の解明」
産学官連携による若手研究イノベータの養成プログラムシンポジウム、2010年2月、名古屋



 

招待講演など



2012


○H. Kandori
“New microbial rhodopsins from the ocean”
15th International Conference on Retinal Proteins
October 3, 2012, Ascona, Switzerland


○H. Kandori
“Light-induced difference FTIR spectroscopy of photoreceptive proteins”
244th ACS National Meeting, Symposium on " Photochemistry in Biology"
August 22, 2012, Philadelphia, USA


○H. Kandori
“Structure-function relationship in microbial rhodopsins”
International Symposium on "Biophysics of Microbial Rhodopsins"
May 18, 2012, Shamghai, China


○H. Kandori
“Mechanism of light-driven ion pumps”
International Workshop "From Structure to Dynamics: A New Era of Structural Biology of Protein-Protein Interactions"
March 16, 2012, Nagoya, Japan


○井上圭一
「ロドプシンの謎に分子科学は迫れるか?」
分子研研究会「次世代分子科学に向けた複合研究討論会」、2012315日、岡崎

神取秀樹
ロドプシンの分光研究」
慶応大学医学部薬理学教室セミナー、201235日、東京

福田哲也浅井佑介古谷祐詞、清水啓史、老木成稔、神取秀樹
「酸性におけるKcsAチャネルの全反射赤外分光解析」
特定領域研究「高次系分子科学」ミニ公開シンポジウム「イオンチャネル研究の現状とこれからについて考える」、2012123日、大阪 

神取秀樹
「イオン輸送性ロドプシンのイオン透過」
若手研究者による分野間連携研究プロジェクト、2012112日、箱根

 


2011


岩田達也
「フラビンを発色団とする光センサータンパク質」
生物物理化学研究会シンポジウム「光といのち」、20111225日、名古屋

井上圭一
「物理化学者十年選手の考える光分子生物学」
生物物理化学研究会シンポジウム「光といのち」、
20111225日、名古屋

神取秀樹
「タンパク質科学における赤外差スペクトル分光法の可能性」
大阪大学蛋白質研究所セミナー「タンパク質科学の未来を語る」
実験・理論研究者の対話
20111121日、大阪

神取秀樹
「レチナール蛋白質とフラビン蛋白質の光応答」
東大物性研研究会「エネルギー変換の物性科学」、
20111114日、柏

○井上圭一
過渡回折格子法でみえる微生物型ロドプシンの新たな光反応
溶液化学シンポジウム・プレシンポジウム、20111114日、名古屋

神取秀樹
「フラビン蛋白質のどこが面白いか?」
高次系分子科学 ミニ公開シンポジウム「光受容タンパク質」、
20111026日、蒲郡

K. Inoue
“Transient grating study on the microbial rhodopsins”
BIT's 1st Annual World Congress of Nanoscience and Nanotechnology,
October 24, 2011, Dalian, China

○H. Kandori
“FTIR study of retinal and flavin proteins in action”
IMS Symposium on "Recent Developments of Spectroscopy and Spatial and Temporal Hierarchical Structures in Molecular Science”
October 18, 2011, Okazaki, Japan

○H. Kandori
“FTIR study of flavin binding proteins”
International Workshop on “Spectroscopy on Photoinduced Functions of Electrons and Spins in Biology and Material Science
October 13, 2011, Tokyo, Japan

○H. Kandori
“New experimental tools for structural changes of membrane proteins: Beyond X-ray structures”
The 49th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 17, 2011, Himeji, Japan
Symposium Organizer

K. Inoue
“Transient grating study of microbial rhodopsins and a new TG technique”
The 49th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, September 17, 2011, Himeji, Japan

井上圭一
膜タンパク質の隠されたダイナミクスを見る−過渡回折格子法と光受容タンパク質
生理研研究会「作動中の膜機能分子の姿を捉える −静止画から動画へ−」
201199日、岡崎

井上圭一
光情報伝達タンパク質の反応機構の解明に向けた新規分光法の開発と応用
名工大−基生研合同講演会2011829日、名古屋

○H. Kandori
“FTIR study of the photolyase/cryptochrome family proteins ”
5th Asia Oceania Conference on Photobiology
August 1, 2011, Nara, Japan

神取秀樹
「ロドプシン研究の基礎と応用」
名工大−生理研 合同講演会、
2011720日、名古屋

○H. Kandori
“Molecular mechanism of rhodopsins in action”
14th Korea-Japan Joint Symposium on Frontiers of Molecular Science
July 8, 2011, Busan, Korea

神取秀樹
「生体π空間の分子科学」
生体分子科学討論会、
2011624日、筑波

○H. Kandori
“Role of protein-bound water molecules in rhodopsins”
TRVS (Time-Resolved Vibrational Spectroscopy) XV
June 21, 2011, Ascona, Switzerland

○H. Kandori, and
K. Katayama
“Role of protein-bound water molecules in rhodopsins”
Seminar in Paul Scherrer Institute
June 17, 2011, Villigen, Switzerland


K. Katayama, Y. Furutani, H. Imai and H. Kandori
“FTIR study of monkey green- and red-sensitive pigments

Seminar in Paul Scherrer Institute
June 17, 2011, Villigen, Switzerland


○H. Kandori
“FTIR detection of protein-bound water molecules in membrane proteins”
Mini-symposium “Biophysics on functional study of proteins”
June 14, 2011, Berlin, Germany

K. Katayama, Y. Furutani, H. Imai and H. Kandori
 “FTIR study of monkey green- and red-sensitive pigments

 Mini-symposium “Biophysics on functional study of protein”
June 14, 2011, Berlin, Germany

神取秀樹
「光といのち:生物の光利用戦略」
夢ナビライブ、
201164日、名古屋

T. Iwata
“Light-induced activation processes of the cryptochrome/photolyase family detected by FTIR spectroscopy”
BIT Life Sciences’ 2nd Symposium on Enzymes & Biocatalysis-2011, April 27, 2011, Dalian, China


H. Kandori
“Mechanism of light-driven ion pumps”
7th Asian Biophysics Association Symposium, February 1, 2011, New Delhi, India

H. Kandori
“Active internal waters in visual and microbial rhodopsins”
Keystone Symposia on "Transmembrane Signaling by GPCRs and Channels",
January 25, 2011, Taos, USA



2010


H. Kandori
“Mechanism of light-driven ion pumps”
PACIFICHEM 2010, Symposium "Frontiers of Biomolecular Dynamics", December 20, 2010, Honolulu, Hawaii

神取秀樹
「生物物理、今後の50年」
パネルディスカッション司会、2010年12月2日、東京

神取秀樹
「ヒトはなぜ赤と緑を見分けることができるのか?」
名工大・名市大合同テクノフェア シーズ発表会、2010年11月17日、名古屋


H. Kandori
“Molecular mechanism of rhodopsins in action”
9th International Conference on Photonics and Imaging in Biology and Medicine, November 3, 2010, Wuhan, China

神取秀樹
「ロドプシンを究める、ロドプシンをつくる、ロドプシンでつくる」
第11回 四セラミックス研究機関 合同講演会「これからのセラミックス環境材料を考える」、2010年9月30日、名古屋


K. Inoue
“Dynamic conformational change of sensory rhodopsin II and transducer studied by transient grating method”
International Conference on Recent Frontiers in Applied Spectroscopy (ICORFAS-2010), September 23, 2010, Tamil Nadu, India

T. Iwata
“Structural analysis of the photoreactions of flavin-binding proteins by FTIR spectroscopy”
2nd International Conference on Biotechnology and Biosciences, September 23, 2010, Bali, Indonesia

神取秀樹
「ロドプシンにおける構造機能相関の解析」
生理学研究所研究会「作動中の膜機能分子の姿を捉える:静止画から動画へ」、2010年9月17日、岡崎

神取秀樹
「ロドプシンの分子科学」
分子科学討論会、2010年9月15日、大阪


H. Kandori
“FTIR study of rhodopsins”
The 14th International Conference on Retinal Proteins, August 5, 2010, Santa Cruz, USA

H. Kandori
“Spectroscopic study of rhodopsins in action”
The 2010 International Meeting of MSK (Microbiological Society of Korea), May 7, 2010, Uljin, Korea

神取秀樹
「光に応答しない膜機能分子の赤外分光測定:プロトンチャネルの構造解析に向けて」
VSP 研究会、2010年4月21日、三崎

神取秀樹
「ロドプシンの赤外分光:赤外線から機能が見える?」
分子科学研究所研究会「拡がるロドプシンの仲間から”何がわかるか”、”何をもたらすか”、2010年3月23日、岡崎


H. Kandori
"Structural study of color visual pigments"
Hominization conference, "Primate Genomics for Globalization of Collaboration Program", March 4, 2010, Inuyama, Japan



 

外部資金導入

やや不足気味





 

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